Biochimica

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Chi siamo

 

Responsabile scientifico:

Prof.ssa Barbara CELLINI

Personale afferente:

  • Barbara CELLINI   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Ilaria BELLEZZA   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Davide CHIASSERINI  Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Lara MACCHIONI   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Mirco DINDO  Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Pier Luigi ORVIETANI   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Magdalena DAVIDESCU   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Silvia GROTTELLI   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Leonardo GATTICCHI   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Gioena PAMPALONE   Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  • Marcello BIANCONI  Questo indirizzo email è protetto dagli spambots. È necessario abilitare JavaScript per vederlo.
  biochimica

Dove siamo

Edificio D piano 2-4, P.zza Lucio Severi, 1 Sant’Andrea delle Fratte 06129 Perugia, Italy

Cosa facciamo

Malattie rare (Barbara CELLINI)
    Basi molecolari di malattie rare associate a deficit enzimatici. Analisi della patogenicità di varianti mediante studi a livello molecolare e cellulare. Sviluppo di approcci terapeutici basati sull’identificazione di ligandi specifici o sulla somministrazione enzimatica.
Disordini legati all'invecchiamento (Ilaria BELLEZZA)
    Sviluppo di modelli cellulari: Studi di tossicità, alterazioni metaboliche e funzionali in modelli cellulari di patologie su base ossidativa, infiammatoria o di deficit enzimatici. Isolamento e caratterizzazione molecolare e funzionale delle vescicole extracellulari da tali sistemi modello.
Alterazioni del metabolismo (Lara MACCHIONI)
    Bioenergetica e metabolismo mitocondriale : Studi di funzionalità mitocondriale in cellule e mitocondri purificati da tessuti, mediante l’analisi dei principali parametri di bioenergetica (potenziale di membrana, consumo di ossigeno, e sintesi di ATP). Attività respiratoria mitocondriale e ruolo della cardiolipina, in diverse condizioni fisiopatologiche tra le quali l’invecchiamento.
Disordini legati all'invecchiamento (Davide CHIASSERINI)
    Biomarcatori proteici e metabolici per malattie neurodegenerative e tumorali. Tecniche di analisi dell’espressione proteica tramite spettrometria di massa in campioni cellulari, tissutali e fluidi biologici. Saggi immunochimici e multiplex per la misura di marcatori in fluidi biologici.

Tecnologie e Strumentazione

Genomics Metagenomics
    Analyses of gene expression molecular biology experiments (plasmid amplification, cloning experiments, reporter gene assays), high-throughput data analyses; molecular modelling analyses.
    Molecular modelling Softwares, Image acquisition system (iBright Thermo).
Proteomics and Metabolomics
    Analysis of Protein Expression, Protein purification techniques, HPLC-based targeted metabolomics, spectrophotometric and spectrofluorimetric assays.
    Isoelettrofocusing apparatus, spectrophotometer, fluorimeter, Image acquisition system (iBright Thermo), FPLC.
Target Identification and Validation
    Expression vector engeneering, site-specific mutagenesis, CRISPR/Cas9 gene editings, protein-protein interaction, protein localization, lentiviral and plasmid protein expression, gene silencing.
    Ultracentrifuges.
Pre-Clinical Models
    Model systems for cell biology, Isolation and characterization of EVs, mitochondrial functional assay, subcellular fractionation.
    Cell culture room, Clark's electrode.

Pubblicazioni

Xuan Y, Bateman NW, Gallien S, Goetze S, Zhou Y, Navarro P, Hu M, Parikh N, Hood BL, Conrads KA, Loosse C, Kitata RB, Piersma SR, Chiasserini D, Zhu H, Hou G, Tahir M, Macklin A, Khoo A, Sun X, Crossett B, Sickmann A, Chen YJ, Jimenez CR, Zhou H, Liu S, Larsen MR, Kislinger T, Chen Z, Parker BL, Cordwell SJ, Wollscheid B, Conrads TP. Standardization and harmonization of distributed multi-center proteotype analysis supporting precision medicine studies. Nat Commun. 2020 Oct 16;11(1):5248. doi: 10.1038/s41467-020-18904-9. PMID: 33067419.

Chiasserini D, van Weering JR, Piersma SR, Pham TV, Malekzadeh A, TeunissenCE, de Wit H, Jiménez CR. Proteomic analysis of cerebrospinal fluidextracellular vesicles: a comprehensive dataset. J Proteomics. 2014 Jun25;106:191-204. doi: 10.1016/j.jprot.2014.04.028. PMID:24769233.

Dindo M, Pascarelli S, Chiasserini D, Grottelli S, Costantini C, Uechi GI, Giardina G, Laurino P, Cellini B. (2022) “Structural dynamics shape the fitness window of alanine:glyoxylate aminotransferase” Protein Sci 31(5):e4303

M. Dindo, S. Grottelli, G. Annunziato, G. Giardina, M. Pieroni, G. Pampalone, A. Faccini, F. Cutruzzolà, P. Laurino, G. Costantino, B. Cellini (2019) “Cycloserine enantiomers are reversible inhibitors of human alanine:glyoxylate aminotransferase: implications for primary hyperoxaluria type 1” Biochem. J.476, 3751-68

R. Montioli, M.A. Desbats, S. Grottelli, M. Doimo, I. Bellezza, C. Borri Voltattorni, L. Salviati, B. Cellini “Molecular and cellular basis of ornithine δ-aminotrasferase deficiency caused by the v332m mutation associated with gyrate atrophy of the choroid and retina” BBA Molecular Basis of Disease (2018) 1864, 3629-38.

Mezzasoma L, Bellezza I, Orvietani P, Manni G, Gargaro M, Sagini K, Llorente A, Scarpelli P, Pascucci L, Cellini B, Talesa VN, Fallarino F, Romani R. Amniotic fluid stem cell-derived extracellular vesicles are independent metabolic units capable of modulating inflammasome activation in THP-1 cells. FASEB J. 2022 Apr;36(4):e22218. doi: 10.1096/fj.202101657R.

Macchioni L, Chiasserini D, Mezzasoma L, Davidescu M, Orvietani PL, Fettucciari K, Salviati L, Cellini B, Bellezza I. Crosstalk between Long-Term Sublethal Oxidative Stress and Detrimental Inflammation as Potential Drivers for Age-Related Retinal Degeneration. Antioxidants (Basel). 2020 Dec 29;10(1):25. doi: 10.3390/antiox10010025.

Grottelli S, Amoroso R, Macchioni L, D'Onofrio F, Fettucciari K, Bellezza I, Maccallini C. Acetamidine-Based iNOS Inhibitors as Molecular Tools to Counteract Inflammation in BV2 Microglial Cells. Molecules. 2020 Jun 6;25(11):2646. doi: 10.3390/molecules25112646.

Macchioni L, Petricciuolo M, Davidescu M, Fettucciari K, Scarpelli P, Vitale R, Gatticchi L, Orvietani PL, Marchegiani A, Marconi P, Bassotti G, Corcelli A, Corazzi L. Palmitate lipotoxicity in enteric glial cells: Lipid remodeling and mitochondrial ROS are responsible for cyt c release outside mitochondria. Biochim Biophys Acta Mol Cell Biol Lipids. 2018 Aug;1863(8):895-908. doi: 10.1016/j.bbalip.2018.04.021.

Petricciuolo M, Davidescu M, Fettucciari K, Gatticchi L, Brancorsini S, Roberti R, Corazzi L, Macchioni L. The efficacy of the anticancer 3-bromopyruvate is potentiated by antimycin and menadione by unbalancing mitochondrial ROS production and disposal in U118 glioblastoma cells. Heliyon. 2020 Dec 19;6(12):e05741. doi: 10.1016/j.heliyon.2020.e05741.