Biologia Cellulare e Molecolare

Dettagli

Chi siamo

 

Responsabile scientifico:

Prof. Giuseppe SERVILLO

Personale afferente:

  biochimica

Dove siamo

Edificio C piano 3, P.zza Lucio Severi, 1 Sant’Andrea delle Fratte 06129 Perugia, Italy

Cosa facciamo

Cancerogenesi e neoplasie (Maria Agnese DELLA FAZIA)
    Studio della proteostasi nel ciclo cellulare. Ruolo del modifier HOPS nella divisione cellulare in condizioni fisiologiche e patologiche. Analisi dell’individuazione di effettori molecolari coordinati da HOPS dalla profase alla citochinesi, in vitro ed in vivo in cellule e topi HOPS-KO.
Cancerogenesi e neoplasie (Giuseppe SERVILLO/Maria Agnese DELLA FAZIA)
    Analisi del tumor escape mechanisms in risposta a stress/danno al DNA in assenza di HOPS. Studio del Cross-road tra DNA Repair, Apoptosi e Senescenza in sistemi in vitro ed in vivo. Attivazione dell’OIS e SASP in risposta ad agenti mutageni in cellule tumorali e in topi HOPS-KO.
Cancerogenesi e neoplasie (Giuseppe SERVILLO)
    Studio del ruolo di HOPS nella regolazione del ripristino delle funzioni apoptotiche delle forme mutate di p53 nei differenti tumori umani. Valutazione di HOPS come un possibile tool terapeutico in virtù della sua sovra-espressione che si accompagna ad apoptosi in selezionati tumori umani.
Cancerogenesi e neoplasie (Giuseppe SERVILLO)
    Identificazione di markers proliferativi nel tumore del polmone per personalizzazione delle terapie antineoplastiche. Lo studio è rivolto principalmente alla comprensione dei meccanismi attraverso i quali la cellula tumorale è in grado di riattivare un gene placentare INSL4, da utilizzare come target terapeutico.
Scienze Omiche Integrate alla Medicina di Precisione (Giuseppe SERVILLO) sitoweb
    Il Laboratorio di Biologia Cellulare e Molecolare della Sezione di Patologia Generale, utilizza nuovi approcci multiomici per implementare l’attività di ricerca oncologica partendo dallo stato dell’arte attuale. Questo é possibile analizzando in maniera accurata i datasets del TCGA (The Cancer Genome Atlas), CPTAC (Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium), CCLE (Cancer Cell Line Encyclopedia) ed ENCODE (EnCyclopedia Of DNA Elements) ed integrandoli con dati sperimentali ottenuti nel nostro laboratorio e dati bioinformatici disponibili su database come GEO (Gene Expression Omnibus) e ChIP-Atlas. Le biotecnologie multiomiche da noi utilizzate, per l’analisi di campioni in studio, sono DNA-Seq, RNA-Seq, ATAC-Seq, ChIP-Seq, CUT&RUN, CUT&TAG, WGBS, MS, Array di metilazione (HM450) e di espressione (Affymetrix). I risultati derivati da tali analisi sono integrati ed analizzati utilizzando il programma R, linguaggio di programmazione specifico per la statistica e la grafica computazionali, insieme a tools e database di analisi come IGV (Integrative Genomics Viewer), Biojupies, CiBioPortal, DepMap Portal, UCSC Xena, GSEA-MsigDB, MEME suite ed altri, cosí da ottenere una visione globale e quanto piú esaustiva della patologia oncologica. L’utilizzo di questi tools permettono di selezionare i migliori modelli sperimentali per studiare meccanismi genetici ed epigenetici del cancro, individuare nuovi markers prognostici e diagnostici e la sperimentazione di nuovi approcci terapeutici per una migliore medicina personalizzata e di precisione.

Tecnologie e Strumentazione

Genomics Metagenomics
    ChIP, analyses of gene expression, Epigenetic tools, Bioinformatic Analyses.
Target Identification and Validation
    Preparation of histological and cytological samples from fixation to staining, Microscope analysis by immunofluorescence, Proximity Ligation Assay (PLA), vector engeneering, cloning and expression.
Pre-Clinical Models
    Model system for cell biology (tumour cell cultures), Extracellular vescicle, Mouse model.
    Cell culture room.

Pubblicazioni

Ferracchiato S, Di-Iacovo N, Scopetti D, Piobbico D, Castelli M, Pieroni S, Gargaro M, Manni G, Brancorsini S, Della-Fazia MA, Servillo G. Hops/Tmub1 Heterozygous Mouse Shows Haploinsufficiency Effect in Influencing p53-Mediated Apoptosis. Int J Mol Sci. 2021 Jul 2;22(13):7186.

Scopetti D., Piobbico D., Brunacci C., Pieroni S., Bellezza G., Castelli M., Ludovini V., Tofanetti F.R., Cagini L., Sidoni A., Puxeddu E., Della-Fazia M.A., Servillo G. INSL4 as prognostic marker for proliferation and invasiveness in Non-Small-Cell Lung Cancer. J. Cancer 2021; 12(13): 3781-3795. doi:10.7150/jca.51332

Bellet MM, Pieroni S, Castelli M, Piobbico D, Fallarino F, Romani L, Della-Fazia MA, Servillo G. HOPS/Tmub1 involvement in the NF-kB-mediated inflammatory response through the modulation of TRAF6. Cell Death Dis. 2020 Oct 15;11(10):865. doi: 10.1038/s41419-020-03086-5. PMID: 33060567; PMCID: PMC7567074.

Della-Fazia MA, Castelli M, Piobbico D, Pieroni S, Servillo G. The Ins and Outs of HOPS/TMUB1 in biology and pathology. FEBS J. 2021 May;288(9):2773-2783. doi: 10.1111/febs.15539. Epub 2020 Sep 13. PMID: 32860479.

Castelli M, Piobbico D, Chiacchiaretta M, Brunacci C, Pieroni S, Bartoli D, Gargaro M, Fallarino F, Puccetti P, Soddu S, Della-Fazia MA, Servillo G. HOPS/TMUB1 retains p53 in the cytoplasm and sustains p53-dependent mitochondrial apoptosis. EMBO Rep. 2020 Feb 5;21(2):e48073. doi: 10.15252/embr.201948073. Epub 2019 Dec 23. PMID: 31867855; PMCID: PMC7001502.

Bellet MM, Masri S, Astarita G, Sassone-Corsi P, Della Fazia MA, Servillo G. Histone Deacetylase SIRT1 Controls Proliferation, Circadian Rhythm, and Lipid Metabolism during Liver Regeneration in Mice. J Biol Chem. 2016 Oct 28;291(44):23318-23329. PubMed PMID: 27634039; PubMed Central PMCID: PMC5087747.

Castelli M, Pieroni S, Brunacci C, Piobbico D, Bartoli D, Bellet MM, Colombo E, Pelicci PG, Della Fazia MA, Servillo G. (2013). Hepatocyte odd protein shuttling (HOPS) is a bridging protein in the nucleophosmin-p19(Arf) network. Oncogene, 32(28):3350-3358

Gambino V, De Michele G, Venezia O, Migliaccio P, Dall'Olio V, Bernard L, Minardi SP, Della Fazia MA, Bartoli D, Servillo G, Alcalay M, Luzi L, Giorgio M, Scrable H, Pelicci PG, Migliaccio E. (2013) Oxidative stress activates a specific p53 transcriptional response that regulates cellular senescence and aging. Aging Cell.; 12(3): 435-45

Della Fazia M.A., Pettirossi V., Ayroldi E., Riccardi C., Viola Magni M. and Servillo G. “Differential expression of CD44 isoforms during liver regeneration in rats”. Journal of Hepatology. 2001, 34: 555-561.

Servillo G., Della Fazia M.A., and Sassone-Corsi P. Transcription factor CREM regulates the timing of hepatocyte proliferation upon liver regeneration. Genes & Development. 1998; 12: 3639-3643.